Zgodnie z art. 106b ust. 1 pkt 4 ustawy o VAT, przedsiębiorca zobowiązany jest wystawić fakturę dokumentującą otrzymanie przez niego przed dokonaniem sprzedaży całości lub części zapłaty. Czy jednak w każdym przypadku otrzymania przed dostawą towaru lub usługi zaliczki, należy ją udokumentować fakturą?

Zasadą jest, że w przypadku wystawienia faktury zaliczkowej, dokumentującej całą zapłatę za dostawę, przedsiębiorca nie wystawia już faktury końcowej. W przypadku gdy wystawił kilka faktur zaliczkowych, za tzw. fakturę końcową uznaje się wówczas ostatnią z tych faktur, dokumentującą ostatnią część zapłaty za dostawę towaru lub wykonanie usługi. W wydanej 29 maja 2019 r. interpretacji podatkowej, Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej poinformował jednak, że „obowiązujące przepisy prawa podatkowego nie zabraniają wystawiania faktur końcowych, które będą dodatkowym dowodem potwierdzającym dokonanie sprzedaży i z których wynikać będzie, że należność w całości została uregulowana” (sygn. 0111-KDIB3-1.4012.186.2019.2.KO).